Что показывает ДНК тест

Ноябрь 27, 2018 Рубрика: Научная база
Что показывает ДНК тест

Результат ДНК-теста дает гарантированно точные ответы относительно того, являются ли два человека родственниками или нет. После выполнения тестирования клиент получает на руки подробный отчет, в котором содержится несколько показателей и большое количество цифр. Это одновременно научный и юридический документ, поэтому вопрос, как понять ДНК тест, волнует всех, кто заказал генетическое исследование.

Расшифровка ДНК-теста

После получения образцов ДНК в лаборатории приступают к извлечению генетических маркеров. В таблице отчета о родстве указаны каждый из них. Есть две колонки: одна колонка для предполагаемого отца, одна – для ребенка. Иногда добавляют третью – например, для анализа образца матери. 

Хотя в этой таблице указан 21 генетический маркер (или, как его еще называют, локус – увеличенный фрагмент ДНК), фактически проверяются 20 из них. 21-й генетический маркер известен как ген пола –  амелогенин. Этот ген является одним из многих генов, определяющих пол. Этот ген анализирует только для чтобы убедиться, что клиенты не ошиблись при упаковке своих образцов.

В каждом из локусов находятся так называемые короткие тандемные повторы, наследуемые от обоих родителей. Проще говоря, это молекулярные маркеры родства. Во второй и третьей колонке вы увидите числа – это количество таких маркеров. К примеру, в первом локусе (D13S1358) указаны значения 16 и 18, то есть 18 переданы от отца. В случае когда ребенок наследует и от отца, и от матери один и тот же набор маркеров (аллель), дается одно число. К примеру, во втором локусе vWA, который содержит данная расшифровка анализа ДНК, стоит только одно число 17.

Индекс отцовства

Это показатель, с помощью которого определяются шансы наследования ребенком обязательной аллели от предполагаемого отца, а не случайного мужчины, который не проходит тестирование. Индекс отцовства (PI) подсчитывается для каждого маркера родства математическим путем. В таблице вы увидите это число возле каждого локуса. Например, возле локуса D16S539 стоит индекс 1,75. Это достаточно высокий индекс, говорящий о сильном совпадении. Однако, если известно, что большинство людей будут иметь аллельное значение 12 в этом месте, PI может быть меньше, например 0,83. Таким образом, в ДНК обоих участников есть совпадение, но это может быть связано с разными вероятностями: либо с тем, что один из них действительно является биологическим отцом ребенка, либо с тем, что большинство людей в этой популяции имеют такое же значение аллеля в этом месте.

Позже все индексы объединяют вместе путем умножения всех отдельных PI, чтобы получить комбинированный индекс отцовства. Комбинированный индекс отцовства, или CPI, – это алгоритм, используемый для установления вероятности отцовства. CPI, как показано в наших примерах, позволяет определить процентную вероятность того, что испытуемый человек исключается или не исключается в качестве биологического отца ребенка.

Если ДНК тест показывает, например, число CPI 200 000, это значит следующее: вероятность отцовства мужчины, который проходит данное тестирование, в 200 000 раз выше, чем вероятность отцовства случайного человека из данной популяции. Если по результатам исследования тестируемый человек не признан отцом, в индексе отцовства будет стоять 0.

Как понять вероятность отцовства?

Для того, чтобы предполагаемый отец считался отцом ребенка (чтобы его биологическое отцовство было «не исключено»), значение CPI должно составлять не менее 100. Значение CPI 100 соответствует вероятности отцовства 99,0000%, значение CPI 10 000 дает вероятность 99,9900% и так далее.

Почему вероятность отцовства не может быть равной 100%? Это связано со статистической погрешностью, поскольку для получения 100% вероятности отцовства необходимо протестировать каждого мужчину данного этноса как предполагаемого отца. Всегда остается небольшая вероятность существования у человека его генетического близнеца.

Однако вероятность отцовства в 99,99% это настолько сильный показатель, что ее принято считать доказательством отцовства. И в этом согласны как ученые-генетики, так и суды во всем мире. Как выглядит исключение отцовства? Этот показатель всегда будет равен 100%.

Как происходит процедура анализа ДНК

Сегодня для ДНК-тестирования используются компьютерное оборудование, которое сделало процедуру точной и быстрой. С его помощью можно не только устанавливать родство, но и выполнять генетическую реконструкцию отцовства без участия отца, определять этническую принадлежность,  резус-фактор плода во время беременности.

Количество ДНК, которое можно извлечь из полученного образца, очень мало, а загрязнение может повлиять на возможность секвенирования. Поэтому ДНК сначала необходимо амплифицировать, сделав множество копий последовательности. Это делается методом ПЦР – полимеразной цепной реакции. При этом фокусируются на 700 000 участков ДНК, которые, как известно, различаются между людьми (остальные 99,9% последовательности практически одинаковы для всех). Эти участки называются SNP – это однонуклеотидный полиморфизм, отличия последовательности дезоксирибонуклеиновой кислоты.

Затем эти амплифицированные участки помещают на маленький чип с множеством пор, которые связывают каждый фрагмент с красным или зеленым флуоресцентным сигналом. Специализированное программное обеспечение затем может прочитать чип и перевести цвета в A, T, G и C. Файл с этой последовательностью позволяет перейти к вычислительному анализу.

В каждой паре хромосом одна хромосома передается от матери и одна от отца. Технология генотипирования, которая читает образец ДНК, определяет, какие генотипы унаследованы от родителей для каждого SNP, а процедура фазирования группирует варианты, унаследованные от каждого из родителей в две отдельные группы для дальнейшего сравнения.

Заказать ДНК-тест в лаборатории Медикал Геномикс Украина

Лаборатория Медикал Геномикс Украина предлагает широкий спектр генетических исследований. Здесь вы можете заказать тест для установления отцовства/материнства, сиблинговые тесты и другие исследования родственных отношений. С помощью ДНК-исследований вы также можете узнать больше о вашем этническом происхождении и том, какую роль играет наследственность и повреждения ДНК в вашем здоровье.

ДНК-исследования в лаборатории Медикал Геномикс Украина – это удобно, качественно и доступно. Вы можете сдать биоматериал в одном из 78 пунктов сбора образцов в 43 городах Украины или заказать набор для домашнего забора материала. В лаборатории используется современное оборудование, которое исключает возможность ошибки и человеческого фактора, а каждый результат проверяется дважды – двумя независимыми группами ученых под руководством четырех докторов наук в генетике.

Понравился пост? Подпишитесь на обновления сайта
Теги:

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *